Voor het nieuwe Alkmaar moest ook een nieuwe burgemeester gekozen. Hiervoor hadden zich diverse kandidaten aangemeld. De gemeenteraad koos in juni opnieuw voor Piet Bruinooge, maar daarmee was het nog niet helemaal gedaan. De ministerraad ging echter op voorstel van minister Plasterk van Binnenlandse Zaken en Koninkrijksrelaties akkoord.
Bruinooge is nog even tijdelijk waarnemend burgemeester. Op 16 september gaat zijn nieuwe ambtstermijn in, de 59-jarige CDA'er is al sinds januari 2007 de Alkmaarse 'burrie'.